Использование платформы «Синтелли» позволило исследовательской команде в лице студента фармацевтического факультета Никитина Константина Андреевича, старшего преподавателя кафедры фармацевтической технологии, кандидата фармацевтических наук Марцевой Дианы Сергеевны и заведующей кафедрой фармацевтической технологии, доктора фармацевтических наук, профессора Жиляковы Елены Теодоровны существенно оптимизировать ранние этапы разработки лекарственных препаратов. Следующим этапом проекта станет экспериментальный синтез выбранных соединений и их дальнейшее исследование на клеточных линиях.

По оценке команды, применение цифровых инструментов может значительно сократить время и финансы, необходимое для ранних этапов разработки лекарств.

«Разработка лекарственных препаратов — это очень длительный процесс, который может занимать 8–10 лет. Если использовать цифровой подход, можно существенно сократить время исследований… С помощью платформы можно перебрать большое количество химических молекул и теоретически получить нужный результат», — отметила Елена Жилякова, заведующая кафедрой фармацевтической технологии, доктор фармацевтических наук, профессор.

Использование платформы позволяет сосредоточить ресурсы на экспериментальной проверке наиболее перспективных соединений и ускорить переход к следующим этапам разработки лекарственных препаратов.


Также узнайте о кейсе применения Синтелли для разработки новых лекарств вместе с «ИНФАМЕД К» https://syntelly.ru/tpost/infamedkcase

Результаты

Разработка новых лекарственных препаратов — длительный и ресурсозатратный процесс. Полный цикл создания лекарства может занимать 8–10 лет, и значительная часть времени уходит на поиск перспективных молекул-кандидатов.

Перед исследовательской командой стояли следующие задачи:

• найти новые молекулы, потенциально способные ингибировать белок BRAF;
• оценить их биологическую активность;
• снизить вероятность токсичности;
• определить возможность синтеза соединений из доступных реагентов.

Для этого было необходимо проанализировать большое количество химических структур и выбрать наиболее перспективные соединения для дальнейших исследований.

Решение

Для ускорения этого процесса исследовательская команда решила использовать платформу цифровой химии «Синтелли». Платформа позволяет анализировать химические структуры, работать с реакциями и прогнозировать свойства соединений,
что помогает оптимизировать ранние этапы разработки лекарств.

С помощью платформы команда выстроила алгоритм поиска новых молекул. На первом этапе были сгенерированы и собраны структуры, сходные с известными ингибиторами BRAF. Далее соединения были отфильтрованы по ключевым параметрам, включая биологическую активность и токсичность.

После этого отобранные соединения были проанализированы с помощью молекулярного докинга для оценки их способности связываться с белком-мишенью.

Одной из наиболее востребованных функций платформы для исследователей стал ретросинтетический анализ. С его помощью специалисты оценивали синтетическую доступность молекул и строили возможные пути их получения.

Кроме того, платформа позволила анализировать спектральные характеристики соединений и прогнозировать их растворимость, что важно для дальнейшей экспериментальной работы.

В ходе моделирования исследователи проанализировали около 700 потенциальных молекул, из которых были отобраны 13 наиболее перспективных соединений, сопоставимых по характеристикам с существующими препаратами.

Задачи

Институт фармации, химии и биологии БелГУ занимается разработкой лекарственных препаратов и фармацевтических технологий. Одним из направлений исследований является разработка потенциальных ингибиторов белка BRAF — биологической мишени, связанной с развитием ряда онкологических заболеваний, включая меланому, рак лёгкого и колоректальный рак.

О проекте