Превратите статьи, патенты и протоколы в рабочие данные за минуты. Автоматическое распознавание химических структур с точностью до 90% освобождает от рутинного перерисовывания формул и позволяет сразу перейти к анализу и синтезу.

PDF2SMILES: Автоматическое извлечение структур из документов

PDF2SMILES решает проблему «запертых» данных в научных публикациях и технической документации. Вместо того чтобы часами вручную перерисовывать структуры из PDF, вы загружаете документ — и получаете машиночитаемые SMILES всех найденных молекул. Это ключевой инструмент для быстрого сбора данных, анализа патентных ландшафтов и построения корпоративных библиотек соединений.

Функциональность

Универсальное распознавание:
Обрабатывает любые типы химической документации: научные статьи, патенты, протоколы испытаний, диссертации, технические отчеты. Поддерживает как стандартные структурные формулы, так и обобщенные структуры Маркуша из патентных документов.
Гибкая работа с результатами:
Выделяйте нужные структуры (одиночный клик, Ctrl+клик для множественного выбора, Shift+клик для диапазона) и управляйте ими: экспортируйте в файл, сохраняйте в датасеты для дальнейшей работы или редактируйте в молекулярном редакторе при обнаружении неточностей.
Бесшовная интеграция:
Распознанные структуры напрямую сохраняются в датасеты Синтелли. Оттуда вы можете мгновенно отправить их на расчет свойств, прогноз реакций, ретросинтетический анализ или визуализацию в SynMap — никакой ручной работы с форматами данных.
Контроль качества:
Интеллектуальные фильтры автоматически отсекают грубые ошибки распознавания. Для критически важных структур доступно ручное редактирование в молекулярном редакторе с сохранением исправленной версии.
Интеллектуальная обработка:
Автоматическое выявление всех структур в документе с визуальной подсветкой найденных молекул. При клике на молекулу в правой панели автоматически подсвечивается соответствующее место в исходном PDF — вы мгновенно видите контекст каждой структуры.

Какие задачи помогает решать?

Образовательные задачи

Преподаватель химии готовит практикум по медицинской химии. Он собирает структуры лекарственных препаратов из учебников и статей через PDF2SMILES, создает тематический датасет и использует его для демонстрации взаимосвязи структуры и биологической активности студентам.

Быстрая проверка синтетических путей

Химик-синтетик читает статью с описанием нового синтеза. Он извлекает все промежуточные соединения из статьи через PDF2SMILES, сохраняет их в датасет и отправляет в модуль ретросинтеза, чтобы проверить альтернативные пути получения с учетом доступных реагентов.

Работа с научной литературой

Исследователь изучает перспективное направление и находит 20 ключевых статей. Вместо того чтобы вручную выписывать и перерисовывать интересные структуры, он пропускает все статьи через модуль, получает датасет из 300+ соединений, рассчитывает для них токсичность и растворимость, выделяет 15 перспективных кандидатов для дальнейшего изучения.

Построение корпоративной библиотеки

Фармацевтическая компания систематизирует 15 лет внутренних отчетов по синтезу. Химик-информатик прогоняет через PDF2SMILES десятки протоколов испытаний, автоматически извлекает все синтезированные соединения и формирует единую базу данных с полной историей разработок компании.

Анализ патентного ландшафта

Патентный эксперт получает 50-страничный патент конкурента с сотнями структур Маркуша. Вместо недельной работы по ручному переносу формул, он загружает PDF в модуль, получает все структуры за 5 минут, сохраняет их в датасет и сразу же отправляет на анализ свойств и поиск пересечений с собственным портфелем компании.
Видео-обзор модуля PDF2SMILES
«У инструмента PDF2SMILES большой потенциал — он существенно ускоряет работу с литературой»
«Понравился PDF to SMILES. Возможность распознавания патентов — это именно то, что нужно для нашего отдела интеллектуальной собственности»
«Функция распознавания и перевода данных из PDF-файлов в рабочий формат экономит часы работы. Особенно полезна интеграция с датасетами — загрузил, распознал, сохранил, и сразу можешь работать дальше»

Отзывы клиентов

10:00-18:00 по Москве
Оцените скорость автоматического извлечения структур из ваших документов и удобство интеграции с другими инструментами платформы
Сообщение об успешной отправке!